Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ID3Q02535 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ID3Q02535 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ID3Q02535 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms