Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms