Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HOXC5Q00444 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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