Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC3P51654 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC3P51654 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC3P51654 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms