Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5OP48047 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms