Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCC3P46736 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms