Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC27P30260 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms