Protein–RNA interactions for Protein: P30039

PBLD, Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBLDP30039 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PBLDP30039 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PBLDP30039 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PBLDP30039 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PBLDP30039 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBLDP30039 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBLDP30039 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBLDP30039 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBLDP30039 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBLDP30039 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PBLDP30039 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms