Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
ARID4AP29374 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARID4AP29374 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID4AP29374 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID4AP29374 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID4AP29374 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID4AP29374 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms