Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMBRP28336 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMBRP28336 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms