Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms