Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA4P25789 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA4P25789 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA4P25789 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms