Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRCP23327 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRCP23327 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRCP23327 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRCP23327 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms