Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNB1P20700 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMNB1P20700 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms