Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms