Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCLP18206 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCLP18206 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCLP18206 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VCLP18206 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VCLP18206 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VCLP18206 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VCLP18206 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms