Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DMDP11532 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DMDP11532 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DMDP11532 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DMDP11532 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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