Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VIPP01282 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VIPP01282 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VIPP01282 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms