Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TANGO2-219ENST00000471707 745 ntTSL 518■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 98.3
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SF3B1O75533 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 98.3
SF3B1O75533 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.182e-6■■■■■ 98.3
SF3B1O75533 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.122e-6■■■■■ 98.3
SF3B1O75533 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 98.3
SF3B1O75533 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 98.3
SF3B1O75533 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 98.3
SF3B1O75533 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 58.32□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 98.3
SF3B1O75533 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 57.67□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 98.3
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SF3B1O75533 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 512.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 98.2
SF3B1O75533 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 98.2
SF3B1O75533 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 98.2
SF3B1O75533 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 98.2
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SF3B1O75533 PSMC3-208ENST00000530887 891 ntTSL 220.19■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 98.2
SF3B1O75533 PSMC3-207ENST00000530651 905 ntTSL 513.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 98.2
SF3B1O75533 PSMC3-210ENST00000531051 777 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 98.2
SF3B1O75533 PSMC3-204ENST00000527906 604 ntTSL 311.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 98.2
SF3B1O75533 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 98.1
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SF3B1O75533 FAM192A-210ENST00000565760 658 ntTSL 320.42■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 98.1
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SF3B1O75533 FAM192A-221ENST00000570184 593 ntTSL 32.72□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 98.1
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SF3B1O75533 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.881e-6■■■■■ 98.1
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SF3B1O75533 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.074e-14■■■■■ 98
SF3B1O75533 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.014e-14■■■■■ 98
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SF3B1O75533 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 98
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SF3B1O75533 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 98
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SF3B1O75533 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 98
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SF3B1O75533 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 98
SF3B1O75533 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 98
SF3B1O75533 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 98
SF3B1O75533 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 98
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SF3B1O75533 TBCD-211ENST00000572984 682 ntTSL 511.78□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 98
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SF3B1O75533 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.818e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.536e-7■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 SLC25A42-204ENST00000597661 519 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 416.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 97.9
SF3B1O75533 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 317.88■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 97.9
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SF3B1O75533 HDAC8-213ENST00000436675 908 ntTSL 516.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 HDAC8-210ENST00000412342 679 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 HDAC8-211ENST00000415409 913 ntTSL 56.92□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 AMOTL1-202ENST00000317829 8844 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.856e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.876e-6■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 97.8
SF3B1O75533 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-8■■■■■ 97.8
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