Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP290O15078 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP290O15078 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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