Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F3O00716 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F3O00716 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms