Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM38O00635 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM38O00635 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms