Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms