Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVV-2B6SEH9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms