Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NPIPB13A6NJU9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB13A6NJU9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms