Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
C9orf92A6NGG3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms