Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms