Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLCA2Q9UQC9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms