Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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