Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms