Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP35Q9P2H5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms