Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATAD3AQ9NVI7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATAD3AQ9NVI7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms