Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREX1Q9NSU2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms