Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C20orf27Q9GZN8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C20orf27Q9GZN8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms