Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF17Q9BXT8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms