Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD1Q9BXT4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms