Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms