Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf50Q9BV19 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms