Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AGMATQ9BSE5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms