Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms