Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL2Q99962 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms