Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP88Q99567 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms