Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSPG4P5Q96PW8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms