Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BORCS6Q96GS4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms