Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW6

SLC7A6OS, Probable RNA polymerase II nuclear localization protein SLC7A6OS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A6OSQ96CW6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC7A6OSQ96CW6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A6OSQ96CW6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms