Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAF2Q96CS3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAF2Q96CS3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms