Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms