Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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