Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AMER3Q8N944 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms