Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00612Q8N6U2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms